geoopt

GitHub
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AI 解读 由 AI 自动生成,仅供参考

geoopt 是一个专为 PyTorch 设计的开源库,旨在让深度学习模型能够在非欧几里得空间(即黎曼流形)中进行高效的自适应优化。传统深度学习通常假设数据位于平坦的欧氏空间,但在处理层级结构、方向数据或复杂图关系时,这种假设往往不够准确。geoopt 通过提供感知流形结构的优化器(如 RiemannianSGD 和 RiemannianAdam),解决了在弯曲空间中进行梯度下降和参数更新的难题,确保模型参数始终约束在特定的几何流形上。

这款工具特别适合 AI 研究人员和高级开发者,尤其是那些从事图神经网络、推荐系统、自然语言处理中层次化表示学习,或需要处理正交矩阵、对称正定矩阵等特殊约束问题的团队。geoopt 的核心亮点在于其丰富的流形实现,涵盖了球面、双曲空间(如 Poincare 球和洛伦兹模型)、Stiefel 流形以及乘积流形等,并提供了完整的张量操作接口(如投影、指数映射和平行移动)。它无缝兼容 PyTorch 生态,允许用户像使用普通张量一样操作流形上的数据,极大地降低了在非欧几何领域进行算法探索和落地的门槛。

使用场景

某生物科技公司算法团队正在构建基于双曲几何的蛋白质层级结构嵌入模型,旨在更精准地捕捉分子间的演化距离。

没有 geoopt 时

  • 开发者需手动编写复杂的黎曼梯度投影代码,极易因数学公式推导错误导致模型无法收敛。
  • 标准 PyTorch 优化器(如 Adam)直接在欧氏空间更新参数,破坏了双曲空间的约束条件,导致嵌入点“飞出”有效流形区域。
  • 缺乏现成的双曲空间算子(如指数映射、平行移动),每次实验都要重复造轮子,研发周期被大幅拉长。
  • 调试困难,难以区分是模型架构问题还是底层几何运算实现有误,排查成本极高。

使用 geoopt 后

  • 直接调用 geoopt.PoincareBall 定义流形,利用内置的 .egrad2rgrad 自动处理梯度投影,确保数学严谨性。
  • 无缝切换至 geoopt.optim.RiemannianAdam,在保持原有训练循环结构的同时,保证参数更新始终落在双曲流形内。
  • 复用库中高度优化的 .expmap.transp 等算子,将原本数周的底层开发工作缩短为几小时的集成测试。
  • 依托成熟的 API 设计,团队能快速迭代不同曲率假设,专注于生物语义分析而非底层数学实现。

geoopt 通过将复杂的黎曼几何优化封装为直观的 PyTorch 接口,让研究人员能零门槛地在非欧几里得空间中训练高性能深度学习模型。

运行环境要求

GPU

未说明

内存

未说明

依赖
notes该工具是 PyTorch 的黎曼优化扩展库。官方支持 PyTorch 最新的两个稳定版本或最新的主要版本。目前项目处于活跃开发阶段,建议通过 GitHub 安装以获取最新功能,PyPI 版本可能滞后。API 在未来版本中可能会发生变化。
python未说明
torch>=2.0.1
geoopt hero image

快速开始

geoopt

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流形感知的 pytorch.optim

非官方实现,用于 “黎曼自适应优化方法”_ ICLR2019 及更多内容。

安装

请确保已安装 pytorch>=2.0.1。

有两种方式可以安装 geoopt:

  1. GitHub(目前推荐),因为开发仍在积极进行中。

.. code-block:: bash

pip install git+https://github.com/geoopt/geoopt.git
  1. pypi(这可能会显著落后于主分支,但会尽可能保持最新)。

.. code-block:: bash

pip install geoopt

一旦项目达到稳定阶段,推荐的安装方式将会改变。目前,由于我们正在积极开发并实现新功能,pypi 版本仍落后于主分支。

PyTorch 支持

Geoopt 官方支持 **PyTorch 最新两个稳定版本** 或最新的主要发布版。

目前已完成的工作
-------------------

工作仍在进行中,但您已经可以使用它了。请注意,API 在未来的版本中可能会发生变化。

张量
~~~~~~~

-  ``geoopt.ManifoldTensor`` - 类似于 torch.Tensor,但增加了 ``manifold`` 关键字参数。
-  ``geoopt.ManifoldParameter`` - 同上,在 ``torch.nn.Module.parameters`` 中被正确识别为子类。

以上所有容器都具有特殊方法,可用于将其作为特定流形上的点进行操作:

-  ``.proj_()`` - 将点就地投影到流形上。
-  ``.proju(u)`` - 将向量 ``u`` 投影到切空间。在使用以下所有方法之前,都需要先对向量进行投影。
-  ``.egrad2rgrad(u)`` - 将梯度 ``u`` 投影到黎曼流形上。
-  ``.inner(u, v=None)`` - 在该点计算两个 **切向量** 的内积。传入的向量无需再投影,假设它们已经处于切空间中。
-  ``.retr(u)`` - 根据向量 ``u`` 进行缩映射。
-  ``.expmap(u)`` - 根据向量 ``u`` 进行指数映射(如果无法以闭式表达,则使用最佳近似值)。
-  ``.transp(v, u)`` - 沿方向 ``u`` 平行移动向量 ``v``。
-  ``.retr_transp(v, u)`` - 沿方向 ``u`` 平行移动 ``self`` 和向量 ``v``(以及可能的其他向量)(返回结果为普通张量)。

流形
~~~~~~~~~

-  ``geoopt.Euclidean`` - 带有欧几里得度量的无约束实数空间流形。
-  ``geoopt.Stiefel`` - 矩阵 Stiefel 流形,满足 ``A in R^{n x p} : A^t A=I``, ``n >= p``。
-  ``geoopt.Sphere`` - 单位球面流形 ``||x||=1``。
-  ``geoopt.BirkhoffPolytope`` - 双随机矩阵流形。
-  ``geoopt.Stereographic`` - 常曲率立体投影模型。
-  ``geoopt.SphereProjection`` - 球面立体投影模型。
-  ``geoopt.PoincareBall`` -  `庞加莱圆盘模型 <https://en.wikipedia.org/wiki/Poincar%C3%A9_disk_model>`_。
-  ``geoopt.Lorentz`` -  `双曲面模型 <https://en.wikipedia.org/wiki/Hyperboloid_model>`_。
-  ``geoopt.ProductManifold`` - 流形乘积构造器。
-  ``geoopt.Scaled`` - 流形的缩放版本。与 ``ProductManifold`` 结合时,类似于 `学习乘积空间中的混合曲率表示 <https://openreview.net/forum?id=HJxeWnCcF7>`_。
-  ``geoopt.SymmetricPositiveDefinite`` - 对称正定矩阵流形。
-  ``geoopt.UpperHalf`` - 西格尔上半平面流形。支持黎曼和芬斯勒度量,如 `图嵌入的对称空间:一种芬斯勒-黎曼方法 <https://arxiv.org/abs/2106.04941>`_ 所述。
-  ``geoopt.BoundedDomain`` - 西格尔有界域流形。支持黎曼和芬斯勒度量。

所有流形都实现了在流形上操作张量以及处理切向量所需的方法,以便在通用场景中使用。更多信息请参阅 `文档`_。

优化器
~~~~~~~~~~

-  ``geoopt.optim.RiemannianSGD`` - 是 ``torch.optim.SGD`` 的子类,具有相同的 API。
-  ``geoopt.optim.RiemannianAdam`` - 是 ``torch.optim.Adam`` 的子类。

采样器
~~~~~~~~

-  ``geoopt.samplers.RSGLD`` - 黎曼随机梯度朗之万动力学。
-  ``geoopt.samplers.RHMC`` - 黎曼哈密顿蒙特卡洛。
-  ``geoopt.samplers.SGRHMC`` - 随机梯度黎曼哈密顿蒙特卡洛。


层
~~~~~~
实验性的 ``geoopt.layers`` 模块允许将 geoopt 嵌入到深度学习中。

引用 Geoopt
~~~~~~~~~~~~~
如果您在研究中发现该项目有用,请在参考文献中添加以下 BibTeX 条目并予以引用。

.. code:: bibtex

    @misc{geoopt2020kochurov,
        title={Geoopt: PyTorch 中的黎曼优化},
        author={Max Kochurov、Rasul Karimov 和 Serge Kozlukov},
        year={2020},
        eprint={2005.02819},
        archivePrefix={arXiv},
        primaryClass={cs.CG}
    }

捐赠
~~~~~~~~~
ETH: 0x008319973D4017414FdF5B3beF1369bA78275C6A
   

.. _“黎曼自适应优化方法”: https://openreview.net/forum?id=r1eiqi09K7
.. _文档: https://geoopt.readthedocs.io/en/latest/manifolds.html


.. |Python Package Index| image:: https://img.shields.io/pypi/v/geoopt.svg
   :target: https://pypi.python.org/pypi/geoopt
.. |Read The Docs| image:: https://readthedocs.org/projects/geoopt/badge/?version=latest
   :target: https://geoopt.readthedocs.io/en/latest/?badge=latest
   :alt: 文档状态
.. |Build Status| image:: https://github.com/geoopt/geoopt/actions/workflows/testing.yml/badge.svg?branch=master
   :target: https://github.com/geoopt/geoopt/actions/workflows/testing.yml
.. |Coverage Status| image:: https://codecov.io/gh/geoopt/geoopt/branch/master/graph/badge.svg?token=HOI5LD0VWF
   :target: https://codecov.io/gh/geoopt/geoopt
.. |Codestyle Black| image:: https://img.shields.io/badge/code%20style-black-000000.svg
   :target: https://github.com/ambv/black
.. |Gitter| image:: https://badges.gitter.im/geoopt/community.png
   :target: https://gitter.im/geoopt/community

版本历史

v0.5.12023/06/23
v0.5.02022/06/29
v0.4.12022/03/15
v0.4.02021/09/02
v0.4.0rc12021/07/01
v0.3.12020/10/29
v0.3.02020/10/07
v0.2.02020/06/12
v0.1.22019/11/30

常见问题

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