pytorch_geometric_temporal

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pytorch_geometric_temporal 是一个专为处理时空数据设计的深度学习扩展库,作为 PyTorch Geometric 的动态版本,它专注于利用神经网络模型进行时空信号处理。在现实世界中,许多数据(如交通流量、疫情传播、能源消耗)不仅包含复杂的节点关系,还随时间动态变化,传统静态图神经网络难以有效捕捉这类时序演化特征。该工具通过集成多种前沿的动态几何深度学习算法和时空回归方法,帮助开发者轻松构建能够同时理解“空间结构”与“时间趋势”的模型。

它非常适合人工智能研究人员、数据科学家以及需要处理动态图数据的工程师使用。无论是进行流行病学预测、共享经济分析,还是网页流量管理,用户都能直接调用库中预置的基准数据集和模型,或利用其便捷的数据加载器、训练集分割器及时序快照迭代器快速搭建实验环境。

技术层面,pytorch_geometric_temporal 具备显著的内存效率优势。其独有的“索引批处理”(index-batching)技术能在不牺牲精度的前提下大幅提升显存利用率,支持更大规模的数据训练。此外,它还原生支持 GPU 加速,并能与 PyTorch Lightning 无缝协作,实现从单卡到多卡分布式训练的快速部署,让复杂的时空建模任务变得更加高效且易于上手。

使用场景

某智慧城市交通部门正利用路网传感器数据,构建模型以预测未来一小时的区域拥堵趋势。

没有 pytorch_geometric_temporal 时

  • 数据结构割裂:开发者需手动编写复杂代码将时间序列与图结构(路口连接关系)强行拼接,难以捕捉空间拓扑随时间的动态变化。
  • 模型复现困难:想要尝试最新的时空回归算法(如 DCRNN 或 T-GCN),必须从零阅读论文并复现底层数学逻辑,研发周期长达数周。
  • 数据处理繁琐:缺乏专用的时间快照迭代器,处理动态图数据时需自行设计滑动窗口和批次加载逻辑,极易出现内存溢出或索引错误。
  • 扩展性差:当路网规模扩大或需要多卡训练时,原有的自定义脚本无法有效支持分布式并行计算,训练效率极低。

使用 pytorch_geometric_temporal 后

  • 原生时空建模:直接调用库内集成的动态几何深度学习模型,天然支持“图 + 时间”联合特征提取,精准捕捉拥堵在路网中的传播规律。
  • 算法即插即用:内置了多种经学术界验证的时空算法接口,研究人员可在几小时内完成从基线模型到 SOTA 模型的切换与对比。
  • 高效数据流水线:利用专用的时间快照迭代器和索引批处理技术,轻松管理动态图数据流,显著降低显存占用并提升数据加载速度。
  • 无缝分布式训练:结合 PyTorch Lightning 和 Dask-DDP,无需修改核心代码即可实现多 GPU 并行训练,将大规模路网的模型训练时间缩短数倍。

pytorch_geometric_temporal 通过标准化时空图神经网络开发流程,让团队从繁琐的基础设施构建中解放出来,专注于解决真实的交通预测难题。

运行环境要求

操作系统
  • 未说明
GPU
  • 支持 GPU(非必需,但框架原生提供 GPU 支持以加速训练)
  • 具体型号、显存大小及 CUDA 版本取决于底层 PyTorch 和 PyTorch Geometric 的安装环境,文中未明确指定最低要求
内存

未说明(提及了索引批处理技术可提高时空内存效率并支持更大规模数据集)

依赖
notes该库是 PyTorch Geometric 的时间动态扩展库。支持使用 Dask-DDP 结合索引批处理进行内存高效的分布式数据并行训练。兼容 PyTorch Lightning,可轻松实现 CPU、单卡及多卡训练。安装前需确保已正确安装对应版本的 PyTorch 和 PyTorch Geometric。
python未说明
torch
torch-geometric
pytorch-lightning (可选)
pytorch_geometric_temporal hero image

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PyPI版本 文档状态 构建状态

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benedekrozemberczki

文档 | 外部资源 | 数据集

PyTorch Geometric TemporalPyTorch Geometric 的一个时序(动态)扩展库。

该库包含来自各类已发表研究论文中的多种动态与时序几何深度学习、嵌入以及时空回归方法。此外,它还配备了一个易于使用的数据集加载器、训练-测试分割工具和用于动态及时序图的时序快照迭代器。框架天然支持 GPU 加速,并附带了来自流行病预测、共享经济、能源生产和网络流量管理等领域的多个基准数据集。最后,用户也可以创建自己的数据集。

PyTorch Geometric Temporal 现在新增了索引批处理功能——一种新的批处理技术,可在不影响精度的情况下提升时空内存效率。请查看 索引批处理示例,这些示例让用户能够轻松地根据自身需求定制训练过程,并扩展到比以往更大的数据集。此外,PyTorch Geometric Temporal 还支持结合索引批处理使用 Dask-DDP 进行内存高效的分布式数据并行训练。

该软件包可与 Pytorch Lightning 良好兼容,从而开箱即用地支持在 CPU、单 GPU 或多 GPU 上进行训练。请参阅此 入门示例,了解如何将 PyTorch Geometric Temporal 与 Pytorch Lightning 结合使用。

我们还为每种 循环模型 提供了详细示例,并为基于注意力机制的模型准备了 笔记本


案例教程

我们在 文档 中提供了深入的案例教程,每个教程都涵盖了 PyTorch Geometric Temporal 功能的一个方面。

增量训练流行病预测案例教程

累积训练网络流量管理案例教程


引用

如果您在研究中发现 PyTorch Geometric Temporal 及其新数据集很有帮助,请考虑添加以下对原始工作及其最新扩展的引用:

@inproceedings{rozemberczki2021pytorch,
               author = {Benedek Rozemberczki 和 Paul Scherer、Yixuan He、George Panagopoulos、Alexander Riedel、Maria Astefanoaei、Oliver Kiss、Ferenc Beres、Guzman Lopez、Nicolas Collignon 和 Rik Sarkar},
               title = {{PyTorch Geometric Temporal: 基于神经机器学习模型的时空信号处理}},
               year = {2021},
               booktitle={第30届 ACM 国际信息与知识管理会议论文集},
               pages = {4564–4573},
}
@misc{ockerman2025pgtiscalingspatiotemporalgnns,
      title={PGT-I:通过内存高效分布式训练扩展时空 GNN}, 
      author={Seth Ockerman、Amal Gueroudji、Tanwi Mallick、Yixuan He、Line Pouchard、Robert Ross 和 Shivaram Venkataraman},
      year={2025},
      eprint={2507.11683},
      archivePrefix={arXiv},
      primaryClass={cs.DC},
      url={https://arxiv.org/abs/2507.11683}, 
}

一个简单示例

PyTorch Geometric Temporal 使得实现动态与时序图神经网络变得相当容易——请参阅随附的 教程。例如,要实现一个包含两个连续的 图卷积 GRU 单元和一个线性层的循环图卷积网络,只需如下代码:

import torch
import torch.nn.functional as F
from torch_geometric_temporal.nn.recurrent import GConvGRU

class RecurrentGCN(torch.nn.Module):

def __init__(self, node_features, num_classes):
        super(RecurrentGCN, self).__init__()
        self.recurrent_1 = GConvGRU(node_features, 32, 5)
        self.recurrent_2 = GConvGRU(32, 16, 5)
        self.linear = torch.nn.Linear(16, num_classes)

    def forward(self, x, edge_index, edge_weight):
        x = self.recurrent_1(x, edge_index, edge_weight)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.recurrent_2(x, edge_index, edge_weight)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.linear(x)
        return F.log_softmax(x, dim=1)

包含的方法

具体而言,实现了以下几种时序图神经网络。

循环图卷积网络

  • DCRNN 来自 Li 等人:《扩散卷积递归神经网络:数据驱动的交通预测》(ICLR 2018)

  • GConvGRU 来自 Seo 等人:《基于图卷积递归网络的结构化序列建模》(ICONIP 2018)

  • GConvLSTM 来自 Seo 等人:《基于图卷积递归网络的结构化序列建模》(ICONIP 2018)

  • GC-LSTM 来自 Chen 等人:《GC-LSTM:用于动态链接预测的图卷积嵌入 LSTM》(CoRR 2018)

  • LRGCN 来自 Li 等人:《在随时间演化的图中预测路径故障》(KDD 2019)

  • DyGrEncoder 来自 Taheri 等人:《利用递归模型学习动态图的演化表示》

  • EvolveGCNH 来自 Pareja 等人:《EvolveGCN:面向动态图的演化图卷积网络》

  • EvolveGCNO 来自 Pareja 等人:《EvolveGCN:面向动态图的演化图卷积网络》

  • T-GCN 来自 Zhao 等人:《T-GCN:用于交通预测的时序图卷积网络》

  • A3T-GCN 来自 Zhu 等人:《A3T-GCN:用于交通预测的注意力时序图卷积网络》

  • AGCRN 来自 Bai 等人:《用于交通预测的自适应图卷积递归网络》(NeurIPS 2020)

  • MPNN LSTM 来自 Panagopoulos 等人:《用于疫情预测的迁移图神经网络》(AAAI 2021)

注意力聚合型时序图卷积网络

  • STGCN 来自 Yu 等人:《时空图卷积网络:一种用于交通预测的深度学习框架》(IJCAI 2018)

  • ASTGCN 来自 Guo 等人:《基于注意力的时空图卷积网络用于交通流量预测》(AAAI 2019)

  • MSTGCN 来自 Guo 等人:《基于注意力的时空图卷积网络用于交通流量预测》(AAAI 2019)

  • GMAN 来自 Zheng 等人:《GMAN:一种用于交通预测的图多注意力网络》(AAAI 2020)

  • MTGNN 来自 Wu 等人:《连接各点:利用图神经网络进行多元时间序列预测》(KDD 2020)

  • 2S-AGCN 来自 Shi 等人:《用于基于骨骼的动作识别的双流自适应图卷积网络》(CVPR 2019)

  • DNNTSP 来自 Yu 等人:《用深度神经网络预测时间序列集合》(KDD 2020)

辅助图卷积网络

  • TemporalConv 来自 Yu 等人:《时空图卷积网络:一种用于交通预测的深度学习框架》(IJCAI 2018)

  • DConv 来自 Li 等人:《扩散卷积循环神经网络:数据驱动的交通流量预测》(ICLR 2018)

  • ChebConvAttention 来自 Guo 等人:《基于注意力机制的时空图卷积网络用于交通流量预测》(AAAI 2019)

  • AVWGCN 来自 Bai 等人:《用于交通预测的自适应图卷积循环网络》(NeurIPS 2020)


请前往我们的文档了解更多关于安装、数据集创建以及已实现方法和可用数据集的完整列表。 若想快速入门,可查看 examples/ 目录下的示例

如果您发现任何异常情况,请提交一个问题。如果您希望添加某个特定的方法,也欢迎提出功能请求


安装

首先安装 PyTorchPyTorch Geometric,然后运行:

pip install torch-geometric-temporal

若需安装支持索引批处理的功能,可运行:

pip install torch-geometric-temporal[index]

若需同时安装索引批处理和分布式数据并行(DDP)支持,可运行:

pip install torch-geometric-temporal[ddp]

运行测试

$ python -m pytest test

许可证

版本历史

0.56.02025/03/28
0.55.02025/02/09
v0.54.02022/09/04
v0.53.02022/07/12
v0.52.02022/04/04
v0.51.02022/02/10
v0.50.02022/01/19
v_000422021/12/31
v_000412021/09/11
v_000402021/08/04
v_000392021/07/25
v_000382021/07/13
v_00372021/06/12
v_000352021/06/04
v_000342021/05/19
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