Bayesian-Neural-Networks
Bayesian-Neural-Networks 是一个基于 PyTorch 的开源项目,专注于提供多种贝叶斯神经网络近似推断方法的代码实现。它旨在解决传统深度学习模型中常见的“过度自信”问题,通过量化预测不确定性,让模型不仅能给出预测结果,还能评估该结果的可靠程度,从而在医疗诊断、自动驾驶等高风险场景中提升决策安全性。
该项目非常适合人工智能研究人员、算法工程师以及对概率深度学习感兴趣的学生使用。无论是希望复现经典论文实验,还是需要在回归分析或图像分类任务中引入不确定性估计,都能从中找到成熟的参考代码。
其核心技术亮点在于集成了多种前沿算法,包括 Bayes by Backprop、MC Dropout、随机梯度朗之万动力学(SGLD)以及局部重参数化技巧等。特别是局部重参数化技巧,通过将采样对象从权重转换为激活值,显著降低了估计方差并加快了收敛速度。此外,项目还贴心地提供了针对 MNIST 分类和 UCI 回归数据集的完整实验脚本及 Google Colab 笔记本,用户无需复杂配置即可直接在云端 GPU 上运行和验证模型,极大地降低了贝叶斯深度学习的研究与开发门槛。
使用场景
某医疗影像初创公司的算法团队正在开发肺炎 X 光片辅助诊断系统,急需模型不仅能给出判断结果,还能在遇到模糊或异常病例时准确提示“不确定”,以避免误诊风险。
没有 Bayesian-Neural-Networks 时
- 传统深度学习模型面对从未见过的噪声图像或罕见病灶时,仍会输出极高的错误置信度,导致医生无法识别模型的“盲目自信”。
- 团队难以区分数据本身的噪声(同方差)与不同患者个体差异带来的不确定性(异方差),只能采用统一的误差假设,降低了诊断精度。
- 为了评估模型可靠性,开发人员不得不手动编写复杂的蒙特卡洛采样代码或集成多个模型,实验周期长且极易出错。
- 缺乏对权重分布的可视化手段,无法通过分析权重的不确定性来剪枝优化模型,导致部署到边缘设备时资源占用过高。
使用 Bayesian-Neural-Networks 后
- 利用 MC Dropout 和 Bayes by Backprop 等算法,模型在面对模糊影像时能主动输出高不确定性预警,提示医生进行人工复核,显著降低漏诊率。
- 通过内置的同方差与异方差回归实验模块,团队能精准分离数据噪声与模型认知局限,针对复杂病例动态调整诊断策略。
- 直接调用预置的 SGLD 或 KF-Laplace 推理接口,无需重复造轮子即可快速对比多种近似推断方法的效果,将算法验证效率提升数倍。
- 借助提供的权重分布绘图与剪枝工具,团队成功剔除了冗余参数,在保持不确定性评估能力的同时,将模型体积压缩了 40%,顺利部署至便携式检测终端。
Bayesian-Neural-Networks 让 AI 模型从“只会答题”进化为“懂得质疑”,在高风险决策场景中提供了至关重要的可信度量化能力。
运行环境要求
- 非必需
- 如有 CUDA 环境会自动使用,但模型较小,CPU 亦可运行
未说明

快速开始
贝叶斯神经网络
以下是几种近似推断方法的 PyTorch 实现:
我们还提供了以下代码:
前置条件
- PyTorch
- Numpy
- Matplotlib
该项目使用 Python 2.7 和 PyTorch 1.0.1 编写。如果系统支持 CUDA,它将自动被使用。这些模型并不庞大,因此也可以在 CPU 上运行。
使用方法
结构
回归实验
我们在玩具数据集上进行了同方差和异方差回归实验,这些数据集是通过 (高斯过程真值) 生成的,同时也对真实数据(六个 UCI 数据集)进行了实验。
Notebooks/classification/(ModelName)_(ExperimentType).ipynb: 包含使用 (ModelName) 在 (ExperimentType) 上进行的实验,即同方差/异方差。异方差笔记本为给定的 (ModelName) 同时包含了玩具数据集和 UCI 数据集的实验。
我们还提供了 Google Colab 笔记本。这意味着你可以在 GPU 上免费运行!无需任何修改——所有依赖项和数据集都已内置在笔记本中——只需选择“运行时”->“更改运行时类型”->“硬件加速器”->“GPU”即可。
MNIST 分类实验
train_(ModelName)_(Dataset).py: 在 (Dataset) 上训练 (ModelName)。训练指标和模型权重将保存到指定的目录中。
src/: 通用工具和模型定义。
Notebooks/classification: 各种笔记本,可用于训练、评估模型以及运行数字旋转不确定性实验。它们还可以绘制权重分布并进行权重剪枝。此外,它们还允许加载预训练模型进行实验。
贝叶斯反向传播 (BBP)
(https://arxiv.org/abs/1505.05424)
带有回归模型的 Colab 笔记本:BBP 同方差 / 异方差
在 MNIST 上训练模型:
python train_BayesByBackprop_MNIST.py [--model [MODEL]] [--prior_sig [PRIOR_SIG]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--n_samples [N_SAMPLES]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
如需了解脚本参数说明:
python train_BayesByBackprop_MNIST.py -h
使用拉普拉斯先验可获得最佳效果。
局部重参数化技巧
(https://arxiv.org/abs/1506.02557)
贝叶斯反向传播推断中,激活的均值和方差以闭式解计算。采样的是激活值而非权重。这使得蒙特卡洛 ELBO 估计量的方差随 minibatch 大小 M 成 1/M 的比例变化。而采样权重则会使方差变为 (M-1)/M。高斯分布之间的 KL 散度也可用闭式解计算,从而进一步降低方差。每轮迭代的计算速度更快,收敛也更快。
在 MNIST 上训练模型:
python train_BayesByBackprop_MNIST.py --model Local_Reparam [--prior_sig [PRIOR_SIG]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--n_samples [N_SAMPLES]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
MC Dropout
(https://arxiv.org/abs/1506.02142)
固定丢弃率为 0.5。
带有回归模型的 Colab 笔记本:MC Dropout 同方差 异方差
在 MNIST 上训练模型:
python train_MCDropout_MNIST.py [--weight_decay [WEIGHT_DECAY]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
如需了解脚本参数说明:
python train_MCDropout_MNIST.py -h
随机梯度朗之万动力学 (SGLD)
(https://www.ics.uci.edu/~welling/publications/papers/stoclangevin_v6.pdf)
为了使模型收敛到真实的后验分布,学习率应根据 Robbins-Monro 条件进行退火。但在实际应用中,我们通常使用固定的学习率。
带有回归模型的 Colab 笔记本:SGLD 同方差 / 异方差
在 MNIST 上训练模型:
python train_SGLD_MNIST.py [--use_preconditioning [USE_PRECONDITIONING]] [--prior_sig [PRIOR_SIG]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
如需了解脚本参数说明:
python train_SGLD_MNIST.py -h
pSGLD
(https://arxiv.org/abs/1512.07666)
带有 RMSprop 预条件的 SGLD。与普通 SGLD 相比,应使用更高的学习率。
在 MNIST 上训练模型:
python train_SGLD_MNIST.py --use_preconditioning True [--prior_sig [PRIOR_SIG]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
自助 MAP 集成
多个网络在数据集的子样本上进行训练。
带有回归模型的 Colab 笔记本:MAP 集成 同方差 / 异方差
在 MNIST 上训练集成:
python train_Bootrap_Ensemble_MNIST.py [--weight_decay [WEIGHT_DECAY]] [--subsample [SUBSAMPLE]] [--n_nets [N_NETS]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
如需了解脚本参数说明:
python train_Bootrap_Ensemble_MNIST.py -h
克罗内克分解拉普拉斯近似
(https://openreview.net/pdf?id=Skdvd2xAZ)
首先训练一个MAP网络,然后计算后验分布模式附近曲率的二阶泰勒展开近似。这里采用块对角Hessian近似,仅考虑层内依赖关系。进一步将Hessian近似为单个数据点Hessian因子期望的克罗内克积。近似Hessian可能需要较长时间,但幸运的是只需执行一次。
在MNIST数据集上训练MAP网络并近似Hessian:
python train_KFLaplace_MNIST.py [--weight_decay [WEIGHT_DECAY]] [--hessian_diag_sig [HESSIAN_DIAG_SIG]] [--epochs [EPOCHS]] [--lr [LR]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
如需了解脚本参数说明:
python train_KFLaplace_MNIST.py -h
请注意,我们保存了未缩放且未逆化的Hessian因子。这将允许在推理时以较低的计算成本调整先验,而无需重新计算Hessian。推理过程需要对近似的Hessian因子进行逆运算,并从矩阵正态分布中采样。相关示例请参见notebooks/KFAC_Laplace_MNIST.ipynb。
随机梯度哈密顿蒙特卡洛
(https://arxiv.org/abs/1402.4102)
我们实现了该算法的自适应尺度版本,该版本由此处提出,用于在预热阶段自动寻找超参数。我们在网络权重上施加高斯先验,并在高斯先验的精度上设置伽马超先验。
运行SG-HMC-SA预热和采样器,并将权重保存到指定文件中:
python train_SGHMC_MNIST.py [--epochs [EPOCHS]] [--sample_freq [SAMPLE_FREQ]] [--burn_in [BURN_IN]] [--lr [LR]] [--models_dir [MODELS_DIR]] [--results_dir [RESULTS_DIR]]
如需了解脚本参数说明:
python train_SGHMC_MNIST.py -h
神经网络中的近似推断
MAP推断提供参数值的点估计。当输入为分布外数据(例如旋转后的数字)时,这些模型往往会以很高的置信度做出错误预测。
不确定性分解
我们可以通过预测熵来衡量模型预测中的不确定性。可以将这一项分解,以区分两种类型的不确定性:由数据噪声引起的偶然不确定性,可量化为模型预测熵的期望值;以及由模型本身引起的认知不确定性,可通过总熵与偶然不确定性的差值来衡量。
结果
同方差回归
玩具同方差回归任务。数据由具有RBF核(l = 1, σn = 0.3)的GP生成。我们使用一个单输出全连接网络,包含一层200个ReLU单元,用于预测回归均值μ(x)。固定log σ则单独学习。
异方差回归
与前一节相同,但log σ(x)根据输入预测。
玩具异方差回归任务。数据由具有RBF核(l = 1, σn = 0.3 · |x + 2|)的GP生成。我们使用一个双头网络,包含200个ReLU单元,分别预测回归均值μ(x)和对数标准差log σ(x)。
UCI数据集上的回归
我们在六个UCI数据集上进行了异方差回归(包括housing、concrete、energy efficiency、power plant、red wine和yacht),采用10折交叉验证。所有实验都包含在异方差笔记本中。需要注意的是,结果高度依赖于超参数的选择。下方图表展示了训练集(半透明颜色)和测试集(实心颜色)上的对数似然和RMSE。圆圈和误差线分别对应10折交叉验证的均值和标准差。
MNIST分类
除MAP模型外,其他模型均使用100个权重样本进行权重边缘化处理,而MAP模型仅使用一组权重。
| MNIST测试 | MAP | MAP 集成 | BBP 高斯 | BBP GMM | BBP 拉普拉斯 | BBP 局部重参数化 | MC Dropout | SGLD | pSGLD | |:--------------: |:-------: |:-------------------: |:--------------: |:---------: |:-------------: |:-------------------: |:----------: |:-------: |:-------: | | Log Like | -572.9 | -496.54 | -1100.29 | -1008.28 | -892.85 | -1086.43 | -435.458 | -828.29 | -661.25 | | Error % | 1.58 | 1.53 | 2.60 | 2.38 | 2.28 | 2.61 | 1.37 | 1.76 | 1.76 |
所考察方法在MNIST测试上的结果。未进行大规模超参数调优。我们使用100个MC样本近似后验预测分布。采用两层各1200个ReLU单元的全连接网络。若未指定,则先验为标准差为0.1的高斯分布。p-SGLD使用RMSprop预条件。
关于Bayes By Backprop的原始论文(https://arxiv.org/abs/1505.05424)报告称,在MNIST数据集上误差约为1%。我们发现,只有当近似后验方差初始化为非常小(BBP Gauss 2)时,才能达到这一效果。在这种情况下,权重分布接近狄拉克δ函数,虽然预测性能良好,但不确定性估计较差。然而,当将方差初始化为与先验一致(BBP Gauss 1)时,便得到了上述结果。这两种超参数配置方案的训练曲线如下所示:
MNIST 不确定性
通过在 MNIST 测试集上添加旋转来生成 OOD 样本时获得的总不确定性、随机性和认知不确定性:
在 KMNIST 数据集上测试我们基于 MNIST 训练的模型时获得的总不确定性和认知不确定性:
对抗鲁棒性
当我们向模型输入对抗样本(FGSM)时,所获得的总不确定性、随机性和认知不确定性。
权重分布
从每个基于 MNIST 训练的模型中采样得到的权重直方图。我们为每个模型抽取了 10 个权重样本。
权重剪枝
#TODO
常见问题
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