multidim-positional-encoding

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617 36 非常简单 1 次阅读 6天前MIT开发框架
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multidim-positional-encoding 是一个专为 PyTorch 和 TensorFlow 设计的开源库,旨在为深度学习模型提供灵活的位置编码实现。在经典的 Transformer 架构中,位置编码通常仅支持一维序列数据,难以直接应用于图像(2D)或视频、体素数据(3D)等多维场景。该工具通过扩展正弦位置编码算法,完美解决了这一局限,支持对 1D、2D 及 3D 张量进行高效编码。

它允许开发者轻松处理形状为 (batchsize, x, ch)(batchsize, x, y, ch) 乃至 (batchsize, x, y, z, ch) 的输入数据,并自动沿通道维度计算位置信息。此外,它还贴心地提供了针对不同张量排列顺序(如通道在前)的变体类,以及可直接将编码结果与输入相加的辅助模块,极大简化了集成流程。

该工具特别适合从事自然语言处理、计算机视觉及 3D 深度学习的研究人员与工程师使用。其独特的技术亮点在于打破了传统位置编码的维度限制,同时采用了模块化安装设计,用户可根据需求单独安装 PyTorch 或 TensorFlow 版本,无需强制依赖庞大的双框架环境,既轻量又实用。

使用场景

某计算机视觉团队正在开发基于 Transformer 的 3D 医学影像分割模型,需要处理具有空间深度信息的 CT 扫描数据。

没有 multidim-positional-encoding 时

  • 开发者必须手动复现论文中的正弦位置编码公式,并自行推导如何将其从 1D 扩展至 3D 空间,极易出现数学实现错误。
  • 面对 (batch, depth, height, width, channels) 这样复杂的张量维度,需编写大量繁琐的切片与广播代码来对齐位置信息,调试成本极高。
  • 难以灵活适配不同的框架需求,若在 PyTorch 和 TensorFlow 之间迁移项目,往往需要重写整套位置编码逻辑。
  • 当输入张量为通道优先格式(如 (batch, ch, x, y, z))时,缺乏现成的置换(Permute)支持,需额外编写预处理代码。

使用 multidim-positional-encoding 后

  • 直接调用 PositionalEncoding3D 类即可获取标准的 3D 正弦编码,无需关心底层数学推导,确保算法与原始论文严格一致。
  • 工具自动识别并处理高维张量结构,一行代码即可完成位置信息的计算与注入,将原本数十行的样板代码缩减为几行。
  • 同一套 API 同时支持 PyTorch 和 TensorFlow,团队在切换深度学习后端时无需修改核心逻辑,显著提升开发效率。
  • 内置 PositionalEncodingPermute3D 等专用类,原生支持通道优先等不同数据布局,无缝适配各类预训练模型输入。

multidim-positional-encoding 将复杂的多维位置编码标准化为简单的模块调用,让研究人员能专注于模型架构创新而非底层数学实现。

运行环境要求

GPU

未说明

内存

未说明

依赖
notes该工具是一个轻量级的位置编码实现库,支持 PyTorch 和 TensorFlow 框架。用户可根据需要单独安装 PyTorch 版本或 TensorFlow 版本,无需同时安装两者。自 6.0.1 版本起,导入路径已变更:PyTorch 用户需从 `positional_encodings.torch_encodings` 导入,TensorFlow 用户需从 `positional_encodings.tf_encodings` 导入。支持 1D、2D 和 3D 正弦位置编码,并能自动处理通道维度不可被整除的情况。
python未说明
torch (可选)
tensorflow (可选)
multidim-positional-encoding hero image

快速开始

1D、2D 和 3D 正弦位置编码(PyTorch 和 TensorFlow)

代码覆盖率 PyPI 版本 代码风格:black 许可证:MIT

一个 2D 示例

这是一个实用且易于下载的实现,提供了适用于 PyTorch 和 TensorFlow 的 1D、2D 和 3D 正弦位置编码。

它可以对形状为 (batchsize, x, ch)(batchsize, x, y, ch)(batchsize, x, y, z, ch) 的张量进行编码,其中位置编码将沿 ch 维度计算。虽然《Attention is All You Need》论文仅支持在一维上进行位置编码,但本实现将其扩展到了二维和三维。

此外,它也适用于形状为 (batchsize, ch, x) 等的张量。更多信息请参阅使用说明。

注意:自版本 6.0.1 起,导入语法已更改。详情请见相关部分。

要安装,只需运行:

pip install positional-encodings[pytorch,tensorflow]

你也可以分别通过以下命令单独安装 PyTorch 和 TensorFlow 的编码模块:

  • 仅安装 PyTorch 版本:pip install positional-encodings[pytorch]
  • 仅安装 TensorFlow 版本:pip install positional-encodings[tensorflow]

使用说明:

PyTorch

该仓库包含三种主要的位置编码模型:PositionalEncoding{1,2,3}D。此外,还有一个 Summer 类,用于将输入张量与位置编码相加。

import torch
from positional_encodings.torch_encodings import PositionalEncoding1D, PositionalEncoding2D, PositionalEncoding3D, Summer

# 只返回位置编码
p_enc_1d_model = PositionalEncoding1D(10)

# 返回输入与位置编码相加的结果
p_enc_1d_model_sum = Summer(PositionalEncoding1D(10))

x = torch.rand(1,6,10)
penc_no_sum = p_enc_1d_model(x) # penc_no_sum.shape == (1, 6, 10)
penc_sum = p_enc_1d_model_sum(x)
print(penc_no_sum + x == penc_sum) # True
p_enc_2d = PositionalEncoding2D(8)
y = torch.zeros((1,6,2,8))
print(p_enc_2d(y).shape) # (1, 6, 2, 8)

p_enc_3d = PositionalEncoding3D(11)
z = torch.zeros((1,5,6,4,11))
print(p_enc_3d(z).shape) # (1, 5, 6, 4, 11)

对于形状为 (batchsize, ch, x) 或其二维、三维对应形式的张量,在类名前加上 Permute;例如,对于大小为 (batchsize, ch, x) 的 1D 输入,应使用 PositionalEncodingPermute1D 而不是 PositionalEncoding1D

import torch
from positional_encodings.torch_encodings import PositionalEncodingPermute3D

p_enc_3d = PositionalEncodingPermute3D(11)
z = torch.zeros((1,11,5,6,4))
print(p_enc_3d(z).shape) # (1, 11, 5, 6, 4)

请注意,若需覆盖输出数据类型,可在创建编码时指定:

p_enc_3d = PositionalEncodingPermute3D(11, dtype_override=torch.float64)

这在输入张量为整数类型时特别有用,因为否则输出将始终为零(参见问题 #39)。

TensorFlow Keras

本库同样支持 TensorFlow。只需在所有类名前加上 TF 前缀即可。

import tensorflow as tf
from positional_encodings.tf_encodings import TFPositionalEncoding2D, TFSummer

# 只返回位置编码
p_enc_2d = TFPositionalEncoding2D(170)
y = tf.zeros((1,8,6,2))
print(p_enc_2d(y).shape) # (1, 8, 6, 2)

# 返回输入与位置编码相加的结果
add_p_enc_2d = TFSummer(TFPositionalEncoding2D(170))
y = tf.ones((1,8,6,2))
print(add_p_enc_2d(y) - p_enc_2d(y)) # tf.ones((1,8,6,2))

版本 6.0.1 的变更

6.0.1 之前,用户需要同时安装 tensorflowtorch 两个包,而这两个包都相当庞大。现在,用户可以单独安装所需的包,但代码也需要相应调整:

如果使用 PyTorch:

from positional_encodings import * -> from positional_encodings.torch_encodings import *

如果使用 TensorFlow:

from positional_encodings import * -> from positional_encodings.tf_encodings import *

公式

插入位置编码的公式如下:

1D:

PE(x,2i) = sin(x/10000^(2i/D))
PE(x,2i+1) = cos(x/10000^(2i/D))

其中:
x 是二维空间中的一个点
i 是 [0, D/2) 内的整数,D 是 ch 维度的大小

2D:

PE(x,y,2i) = sin(x/10000^(4i/D))
PE(x,y,2i+1) = cos(x/10000^(4i/D))
PE(x,y,2j+D/2) = sin(y/10000^(4j/D))
PE(x,y,2j+1+D/2) = cos(y/10000^(4j/D))

其中:
(x,y) 是二维空间中的一个点
i,j 是 [0, D/4) 内的整数,D 是 ch 维度的大小

3D:

PE(x,y,z,2i) = sin(x/10000^(6i/D))
PE(x,y,z,2i+1) = cos(x/10000^(6i/D))
PE(x,y,z,2j+D/3) = sin(y/10000^(6j/D))
PE(x,y,z,2j+1+D/3) = cos(y/10000^(6j/D))
PE(x,y,z,2k+2D/3) = sin(z/10000^(6k/D))
PE(x,y,z,2k+1+2D/3) = cos(z/10000^(6k/D))

其中:
(x,y,z) 是三维空间中的一个点
i,j,k 是 [0, D/6) 内的整数,D 是 ch 维度的大小

3D 公式只是对 这篇 论文中使用的 2D 阐述的自然扩展。

即使输入的维度不能被 2(1D)、4(2D)或 6(3D)整除,也不用担心;必要的填充会自动处理好。

感谢

感谢 这个 仓库为本方法提供了灵感。

引用文献

1D:

@inproceedings{vaswani2017attention,
  title={Attention is all you need},
  author={Vaswani, Ashish and Shazeer, Noam and Parmar, Niki and Uszkoreit, Jakob and Jones, Llion and Gomez, Aidan N and Kaiser, Łukasz and Polosukhin, Illia},
  booktitle={Advances in neural information processing systems},
  pages={5998--6008},
  year={2017}
}

2D:

@misc{wang2019translating,
    title={Translating Math Formula Images to LaTeX Sequences Using Deep Neural Networks with Sequence-level Training},
    author={Zelun Wang and Jyh-Charn Liu},
    year={2019},
    eprint={1908.11415},
    archivePrefix={arXiv},
    primaryClass={cs.LG}
}

3D: 即将发布!

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