3FS

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9.8k 1k 困难 1 次阅读 今天MIT开发框架数据工具
AI 解读 由 AI 自动生成,仅供参考

3FS(Fire-Flyer File System)是一款专为人工智能训练与推理场景打造的高性能分布式文件系统。它旨在解决大模型开发中面临的海量数据读写瓶颈、存储一致性难保障以及传统缓存成本过高等核心痛点。

该系统特别适合从事大规模 AI 模型训练的算法工程师、系统架构师及科研人员使用。3FS 通过独特的“分离式架构”,能够聚合数千块 SSD 的吞吐能力与数百个存储节点的网络带宽,让应用无需关心数据物理位置即可高效访问。其技术亮点包括:采用 CRAQ 协议确保强一致性,简化了分布式应用的开发逻辑;提供标准的文件接口,开发者无需学习新的 API 即可上手;支持基于事务键值对的无状态元数据服务。

在实际应用中,3FS 不仅能高效管理数据分析流水线的中间产物,还能消除训练时对数据预取或打乱的依赖,实现跨节点的随机高速访问。此外,它为推理过程中的 KVCache 提供了一种高性价比的替代方案,相比传统内存缓存,在保持高吞吐的同时显著扩大了容量。测试数据显示,在大规模集群下,3FS 的聚合读取吞吐量可高达 6.6 TiB/s,是构建高性能 AI 基础设施的理想选择。

使用场景

某大型 AI 实验室正在训练千亿参数大模型,需同时处理海量训练数据加载、高频断点续训及推理阶段的 KVCache 缓存。

没有 3FS 时

  • 数据加载瓶颈:传统存储无法支撑数百个计算节点并发随机读取训练样本,被迫采用复杂的数据预取和打乱策略,仍常因 I/O 等待导致 GPU 闲置。
  • 断点保存缓慢:大规模训练 checkpointing 时,串行或低吞吐的写入过程耗时极长,显著拉长整体训练周期,且故障恢复风险高。
  • 推理成本高昂:推理阶段依赖昂贵的 DRAM 存储 KVCache,显存容量受限导致批处理大小(Batch Size)难以提升,单位 token 生成成本居高不下。
  • 开发维护复杂:缺乏强一致性保证,分布式应用需自行处理数据竞争和状态同步问题,代码逻辑复杂且容易出错。

使用 3FS 后

  • 极致数据吞吐:利用 3FS 的解耦架构和 RDMA 网络,实现跨节点数据的原地随机访问,彻底消除预取需求,GPU 利用率接近 100%。
  • 高速并行落盘:支持高吞吐并行检查点写入,将原本数分钟的保存过程压缩至秒级,大幅缩短训练迭代时间并提升容错效率。
  • 大容量低成本缓存:将 KVCache 卸载至 3FS,以 SSD 的低成本获得远超 DRAM 的缓存容量,显著提升推理吞吐量并降低单次调用成本。
  • 简化开发逻辑:基于 CRAQ 协议的强一致性特性,让开发者无需关心底层数据同步,直接使用标准文件接口即可构建可靠的分布式应用。

3FS 通过融合高性能 SSD 与 RDMA 网络,为 AI 全链路工作负载提供了统一、极速且易用的共享存储底座。

运行环境要求

操作系统
  • Linux (Ubuntu 20.04
  • Ubuntu 22.04
  • openEuler 2403sp1
  • OpenCloudOS 9
  • TencentOS 4)
GPU

未说明

内存

未说明 (测试集群计算节点配置为 2.2 TiB RAM,但非最低运行要求)

依赖
notes该工具是高性能分布式文件系统,主要依赖 RDMA 网络(如 InfiniBand)和 NVMe SSD 硬件以达到最佳性能。编译时需根据集群历史版本指定 SHUFFLE_METHOD (g++10 或 g++11) 以确保二进制兼容性。支持通过 Docker 镜像进行构建。元数据服务依赖 FoundationDB。
python未说明 (仅需 python3-devel 用于开发依赖)
cmake
libuv
liblz4
liblzma
clang-14 / gcc-10 or gcc-12
libfuse (>=3.16.1)
FoundationDB (>=7.1)
Rust toolchain (>=1.75.0, 推荐 >=1.85.0)
libboost
libaio
3FS hero image

快速开始

火萤文件系统

构建 许可证

火萤文件系统(3FS)是一个高性能的分布式文件系统,旨在解决人工智能训练和推理工作负载中的挑战。它利用现代固态硬盘和RDMA网络,提供一个共享存储层,从而简化分布式应用程序的开发。3FS的主要特性与优势包括:

  • 性能与易用性

    • 解耦架构 结合了数千块SSD的吞吐量以及数百个存储节点的网络带宽,使应用能够以不依赖于本地性的形式访问存储资源。
    • 强一致性 实现了按比例查询的链式复制(CRAQ)机制来保证强一致性,使得应用代码简单且易于理解。
    • 文件接口 基于事务型键值存储(如FoundationDB)构建无状态元数据服务。文件接口广为人知且被广泛应用,无需学习新的存储API。
  • 多样化的工作负载

    • 数据准备 将数据分析流水线的输出组织成层次化的目录结构,并高效管理大量中间结果。
    • 数据加载器 通过支持跨计算节点对训练样本的随机访问,消除了预取或打乱数据集的需求。
    • 检查点机制 支持大规模训练中的高吞吐并行检查点操作。
    • 推理用KV缓存 提供了一种经济高效的DRAM替代方案,具备高吞吐量和显著更大的容量。

文档

性能

1. 峰值吞吐量

下图展示了在大型3FS集群上进行读取压力测试时的吞吐量。该集群由180个存储节点组成,每个节点配备2张200Gbps InfiniBand网卡和16块14TiB NVMe SSD。大约500多个客户端节点参与了此次读取压力测试,每个客户端节点配置1张200Gbps InfiniBand网卡。最终总读取吞吐量达到约6.6 TiB/s,同时还有来自训练作业的背景流量。

180节点集群上的大块读取压力测试吞吐量

要对3FS进行基准测试,请使用我们的用于USRBIO的fio引擎

2. GraySort

我们使用GraySort基准测试评估了smallpond,该测试用于衡量大规模数据集上的排序性能。我们的实现采用了两阶段方法:(1) 通过密钥前缀位进行shuffle分区;(2) 在各分区内进行排序。这两个阶段均从3FS读写数据。

测试集群由25个存储节点(每节点2个NUMA域,1个存储服务/NUMA,2×400Gbps NIC/节点)和50个计算节点(2个NUMA域,192个物理核心,2.2 TiB RAM,1×200 Gbps NIC/节点)组成。在30分14秒内完成了对8,192个分区中110.5 TiB数据的排序,平均吞吐率达到3.66 TiB/min

3. KVCache

KVCache是一种用于优化LLM推理过程的技术。它通过在解码器层中缓存先前标记的键和值向量,避免了重复计算。 上图展示了所有KVCache客户端(1×400Gbps NIC/节点)的读取吞吐量,突出了峰值和平均值,其中峰值吞吐量高达40 GiB/s。下图则展示了在同一时间段内垃圾回收(GC)移除操作的IOPS。

KVCache读取吞吐量 KVCache GC IOPS

克隆源代码

从GitHub克隆3FS仓库:

git clone https://github.com/deepseek-ai/3fs

deepseek-ai/3fs已被克隆到本地文件系统后,运行以下命令以检出子模块:

cd 3fs
git submodule update --init --recursive
./patches/apply.sh

安装依赖项

安装依赖项:

# 对于Ubuntu 20.04。
apt install cmake libuv1-dev liblz4-dev liblzma-dev libdouble-conversion-dev libdwarf-dev libunwind-dev \
  libaio-dev libgflags-dev libgoogle-glog-dev libgtest-dev libgmock-dev clang-format-14 clang-14 clang-tidy-14 lld-14 \
  libgoogle-perftools-dev google-perftools libssl-dev libclang-rt-14-dev gcc-10 g++-10 libboost1.71-all-dev build-essential

# 对于Ubuntu 22.04。
apt install cmake libuv1-dev liblz4-dev liblzma-dev libdouble-conversion-dev libdwarf-dev libunwind-dev \
  libaio-dev libgflags-dev libgoogle-glog-dev libgtest-dev libgmock-dev clang-format-14 clang-14 clang-tidy-14 lld-14 \
  libgoogle-perftools-dev google-perftools libssl-dev gcc-12 g++-12 libboost-all-dev build-essential

# 对于openEuler 2403sp1
yum install cmake libuv-devel lz4-devel xz-devel double-conversion-devel libdwarf-devel libunwind-devel \
    libaio-devel gflags-devel glog-devel gtest-devel gmock-devel clang-tools-extra clang lld \
    gperftools-devel gperftools openssl-devel gcc-12 g++-12 libboost-all-dev build-essential

# 对于OpenCloudOS 9和TencentOS 4
dnf install epol-release wget git meson cmake perl lld gcc gcc-c++ autoconf lz4 lz4-devel xz xz-devel \
    double-conversion-devel libdwarf-devel libunwind-devel libaio-devel gflags-devel glog-devel \
    libuv-devel gmock-devel gperftools gperftools-devel openssl-devel boost-static boost-devel mono-devel \
    libevent-devel libibverbs-devel numactl-devel python3-devel

安装其他构建前提条件:

  • libfuse 3.16.1或更高版本
  • FoundationDB 7.1或更高版本
  • Rust工具链:最低1.75.0,推荐1.85.0或更高版本(最新稳定版)

构建3FS

build文件夹中构建3FS:


# 请根据您的环境将 <method> 替换为 'g++10' 或 'g++11'
cmake -S . -B build \
      -DCMAKE_CXX_COMPILER=clang++-14 -DCMAKE_C_COMPILER=clang-14 \
      -DCMAKE_BUILD_TYPE=RelWithDebInfo -DCMAKE_EXPORT_COMPILE_COMMANDS=ON \
      -DSHUFFLE_METHOD=<method>
cmake --build build -j 32

由于历史上一直使用 std::shuffle,因此使用不同编译器版本(例如 g++10g++11+)编译的二进制文件可能存在不兼容问题(问题)。为了解决这一问题,您必须在编译时显式指定 -DSHUFFLE_METHOD,以锁定一致的洗牌算法:

  • 现有集群:请使用之前部署该集群所用编译器版本对应的洗牌方法(g++10g++11)。
  • 新建集群:您可以选择 g++10g++11。然而,一旦集群部署完成,后续的所有构建都必须保持相同的配置,以确保兼容性。

使用 Docker 构建 3FS

  • 对于 TencentOS-4:docker pull docker.io/tencentos/tencentos4-deepseek3fs-build:latest
  • 对于 OpenCloudOS-9:docker pull docker.io/opencloudos/opencloudos9-deepseek3fs-build:latest

运行测试集群

请按照 部署指南 中的说明运行一个测试集群。

报告问题

如有问题,请访问 https://github.com/deepseek-ai/3fs/issues 进行报告。

常见问题

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